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第六期生物数据分析技能实训会

点击次数:2123 发布日期:2016/12/11 来源:华斯泰

在高通量测序技术、生物芯片技术等的推动下,现代生命科学与医学研究已经从单因素分析上升至高通量组学层面。在此基础上,以海量数据挖掘与分析为研究内容的生物信息学就成为科研必要手段,如疾病的病因学、临床诊断标志物、作用靶点识别,关键大分子的发现与功能预测,以及遗传调控机制等方面。我们诚挚邀请您参加2017年1月14日-17日在北京举办的《生物数据分析技能实训会》,特邀伦永志教授担任主讲教师。授课采用伦老师独创的TPS(Teaching-Practicing-Showing教学模式,着力于以实际问题为引线,将理论授课与上机实践有机地融为一体,逐步介绍生物数据分析的各项技能,并指导学员将其融会贯通以真正掌握相关的基本方法与常用工具。TPS教学模式已在近年多期培训班中取得了极佳的教学效果,受到广大学员的一致好评和推崇。

时间地点:
时间:2017年1月13日(周五)报到,14日-17日授课。
地点:北京凯瑞大酒店(北京市海淀区羊坊店西路12号【空军大院东南门右侧】)
主办单位
北京华斯泰生物医学科技有限公司大连励成实验室服务有限公司

培训日程(所有课程均含上机实践):
日期
时间
授课题目 授课内容
1月13日
16:00-21:00
报到(外地学员)  
1月14日
08:00-08:30
报到(北京学员)  
08:30-09:00
预装软件、调试网络  
09:00-12:00
序列的获取 cDNA及基因组参考序列的获取(详细介绍NCBI Gene、Unigene、 Nucleotide数据库使用方法)
常见序列格式的释义与转换
14:00-18:00
序列的比对 双序列比对(局部比对)
多序列比对(全局比对)
多序列保守信息的图形化
电子克隆
1月15日
09:00-12:00
分子进化分析 分子进化与系统进化树
多序列的获取与比对
进化距离的计算
系统进化树的构建
14:00-17:00
非编码RNA注释及靶基因预测 利用miRBase/TargetScan等数据库进行miRNA注释及靶基因预测
利用NONCODE/lncRNAdb等数据库进行lncRNA注释及靶基因预测
17:00-18:00
综合答疑
1月16日
09:00-12:00
基因结构分析 开放阅读框的预测
内含子剪切位点的识别
可变剪接的分析
启动子序列的查询与预测
转录因子结合位点的查询
14:00-16:00
基因功能注释 Gene Ontology(本体)分析
KEGG pathway(通路)分析
16:00-18:00
基因集功能富集分析 利用DAVID在线工具富集分析基因集功能
利用Excel软件、Venn在线工具分别绘制基因集功能富集图及维恩图(Venn分析)
1月17日
09:00-12:00
系统生物学网络结构分析 利用Cytoscape软件进行基因注释、文献检索、分子间相互作用及基因表达分析
14:00-17:00
基因芯片数据处理与分析 利用ArrayTools软件预处理从GEO数据库下载的芯片数据
利用Cluster/Treeview软件进行聚类分析
利用FunNet在线工具进行共表达网络分析
17:00-18:00
综合答疑
具体事宜:
1、培训期间提供午餐,晚餐自理。
2、上机实践需自带笔记本电脑,会场将布置充足的电源插座。请确保电脑配置无线网卡,操作系统为Win XP/ 7/ 8/ 10,而非Mac系统或上网本(个别软件不能运行)。
3、授课幻灯PDF版、软件(附带安装指南)及上机实践已上传至会议专用360云盘,在报到通知中会告知登录名及密码。软件请事先下载并安装。
4、授课最后一天(1月17日)下午仍有重要课程,外地学员需合理安排返程时间。

注册费用:
3200元/人,同一单位两人3000元/人、三人以上2800元/人。授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。按交费先后顺序确定座位号
住宿酒店:
住宿统一安排在北京凯瑞大酒店。标准间单住380元/人、合住190元/人(含早餐),费用自理。对于需要合住的学员,会务组将按报到先后顺序安排,最后出现单人无法安排的情况,需要自补房间差价。
联系方式:
周老师 手机号:13031122230;E-mail:Biodata2016@163.com
迟老师 手机号:18515367262;E-mail:qingyuemedia@163.com  
    
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