010-63625100
                                                        多组学联合网络药理学技术解析疾病及药物机制实践培训班                                                         第七期细胞表型检测及功能分析技术和策略学习班                                                         第二期活体脑化学分析技术学习班                                                         线粒体和细胞死亡课题思路介绍及热点方向分析专题会议                                                         肠道菌群机制研究及国自然课题设计专题会议

微生物组学分析研讨班

点击次数:1763 发布日期:2017/04/09 来源:华斯泰

近年近年来,微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用,成为了上述领域必不可少的研究技术。在此,北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。
   专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值,为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加!

时间地点:
时间:2017年4月28日-20日
地点:北京海淀区丰贤中路7号
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
主办单位:
北京市计算中心、华斯泰生物医学科技有限公司
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室、中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会、北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心、中国生物工程杂志
课程内容:(上课时间:上午:9:30-12:00   下午:1:30-5:00)
日期 授课题目 授课内容
第一天 上午 微生物组学研究的发展和挑战 1、微生物组研究的发展历史 
2、测序平台介绍 
3、基于测序的研究方法 
3.1 宏基因组(target sequencing 和全基因组) 
3.2 单个微生物de novo测序 
4、应用案例分析
第一天 下午 target sequencing数据分析 1、linux常用命令使用和上机操作 
2、数据分析过程中的编程简介(perl、R、python等)
3、target sequencing数据分析加上机 
3.1质控 3.2去嵌合体 
3.3 OTU聚类 
3.4 注释 
3.5统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。
第二天 全天 Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析 1、质控 
2、拼接组装:SOAPdenovo;MetaVelvet; Meta-IDBA等
3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等 
4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等 
5、功能注释:RAMMCAP;Blast等 
6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)表达分析
第三天 全天   微生物de novo测序分析 1、 质控 
2、 单细胞测序去污染、去嵌合体等 
3、拼接组装:SPAdes等 
4、基因预测 
5、功能注释 
6、代谢途径分析 
7、进化分析:(1)SNP;(2)插入缺失(3)水平基因转移; 
8、转录组分析:(1)基因差异表达分析;(2)代谢通路分析
(课程内容以实际授课为准)
【注】:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
收费标准:
注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。

报名优惠政策:
1、3.20日前预报名的学员每人可优惠300元
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、同时报2个以上培训班的可额外优惠200元
5、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
联系方式:
韩海平 13121228066
邮箱:haipinghan@163.com   
   
收缩
  • 电话咨询

  • 13366403928