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基于癌症公共数据库TCGA及SEER的信息挖掘、科研设计和论文撰写研习班

点击次数:12371 发布日期:2018/01/19 来源:华斯泰

    身处大数据时代,对于从事肿瘤研究的临床医生或基础科研人员,有没有一种可以既不做实验又不查病史,直接调用公共数据撰写发表SCI论文的方法呢?TCGA和SEER等癌症公共数据库即提供了这样一种可能。TCGA和SEER分别侧重于组学数据和临床数据,各有优势。TCGA(癌症基因组图谱)数据库是一个多组学的数据库,包括常见癌症的基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临床数据,为挖掘有意义的组学变化和发现肿瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。美国的SEER(癌症监测、流行病学和结果)数据库则是典型的临床医学数据库,是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一,收集了各个癌种的海量临床病理信息和预后数据,并向全世界免费开放,为临床医师的循证实践及临床研究提供了宝贵的第一手资料。据不完全统计,全世界基于TCGA和SEER数据挖掘产生的文章已经超过2000篇,其中不乏最顶尖的学术期刊文章(如JAMA、新英格兰、Nature、Cell等),这一数目还在不断增长中。
    以往的TCGA课程往往侧重于R语言程序的讲解,不少学员反应难以掌握。本课程立足应用和实战,宗旨是“临床医生听得懂、学得会,科研人员亦有收获”。本课程将从临床应用视角介绍癌症公共数据库TCGA、SEER的基本情况、数据库结构、数据获取方式及基本统计方法等,深度解析近年讲课人发表的基于TCGA和SEER数据挖掘的经典案例,重点对癌症公共数据库的数据挖掘和课题设计进行讨论,最后也将探讨在此基础上的基金申请、SCI论文撰写策略。
一、时间地点:
2018年5月19日-20日(5月18日报到)
北京冠京饭店(北京市丰台区丰台北路79号(近丰体南路))

二、学习目标:
本次会议提供了一次系统掌握TCGA和SEER等癌症公共数据库数据结构、挖掘方法及分析流程的机会,目的在于帮助有志于利用这些公共数据库的临床医生、转化研究的科研人员及研究生,以便更好地挖掘利用这些免费的公共数据。本次会议不侧重于深入的生物信息学分析讲授,拟解决的问题包括:1、TCGA及SEER数据库的数据下载; 2、获取数据后如何分析;3、如何基于TCGA及SEER等癌症公共数据库设计课题;4、如何在此基础上撰写SCI论文及申请科研基金。
三、授课方式: 
1、课程讲座; 2、专题小组研讨与案例讲解分析结合;3、上机操作;
(主题明确,针对性强。专题小组研讨与案例讲解分析结合。)
四、参会对象:
主要面向从事肿瘤研究的临床医生、转化研究科研人员、在校研究生以及广大临床肿瘤研究领域的爱好者。
五、主讲专家
本次主讲老师是来自国内知名肿瘤中心的临床医生和科研工作者,有着丰富的应用公共数据和临床数据进行研究的经验,已发表主流SCI论文20余篇,其中成功公共数据库发表多篇SCI,平均每篇影响因子4.5分。
六、课程大纲:

-----第一天-----2018.5.19日(周六)
时间
授课题目
授课内容
8:30-11:50
TCGA数据库入门
1.TCGA数据库入门及数据获取方式解读
2.案例解读:几篇基于TCGA数据库发表文章的深度解析
3.上机实战:TCGA数据的获取
12:00-14:00
午餐与午休
14:00-17:30
SEER数据库挖掘
1.SEER数据库入门(软件安装、数据获取、数据检索)
2.案例解读:几篇基于SEER数据库发表文章的深度解析
3.上机实战:SEER数据库数据处理和分析
-----第二天-----2018.5.20日(周日)
时间
授课题目
授课内容
8:30-11:50
TCGA数据深度挖掘
1.肿瘤组学研究介绍
2.案例解读:如何利用TCGA进行数据挖掘及转化课题设计
3.上机实战:基于TCGA数据挖掘和分析实战
12:00-14:00
午餐与午休
14:00-17:30
论文标书撰写与实用统计方法
1.SCI论文撰写技巧
2.医学基金标书撰写技巧
3.临床科研实用科研统计方法介绍
4.上机实战:实用统计方法实战—以GraphPad软件使用为例
※备注:自带笔记本电脑,安装WINDOWS操作系统,需要SPSS、R、GraphPad Prism 5、SEER*Stat以及Office Excel 2007以上版本等软件。
七、主办单位:
北京华斯泰生物医学科技有限公司

八、收费标准:
4月15日前报名2400元/人,4月15日后报名2600元/人。(费用含午餐费和资料费);住宿统一安排,费用自理。
1.网上汇款或银行转账

户 名:北京华斯泰生物医学科技有限公司
开户行:中国工商银行北京丰益桥支行
帐 号:0200245009200091577
2.支付宝账号
名字:北京华斯泰生物医学科技有限公司
账号:Huasitai@Huasitai.com
3.现场刷卡或现金
您也可以现场刷卡和支付现金。可以刷公务卡
转账后请发电子邮件通知我们,电子邮件中请写明详细转账信息,以便查账,同时写明发票开具单位和具体邮寄地址。
、报名方式:
请填写报名表通过电子邮件发送至Huasitai@263.net
或在线报名(www.Huasitai.com)
十、会务咨询:
联系人:章老师 13121195178李老师 13366403928
电 话010-63625100
E-mail:Huasitai@263.net
   
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