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生物数据分析技能2.0实训会(总第21期)

点击次数:4633 发布日期:2019/05/22 来源:华斯泰

生物医学已进入大数据时代,借助生物医学多组学、多层次的海量数据,可以从前所未有的广度和深度来研究生物体运行机制。由于生物医学数据多呈分散复杂特征,以海量数据挖掘与分析为主体内容的生物信息学技能就成为科研必要手段,如疾病的病因学、临床诊断标志物、治疗或作用靶点识别,关键大分子的发现与功能预测,以及遗传调控机制等方面。会议特邀伦永志教授担任主讲教师。本课程曾先后用名《基因序列分析技术》和《功能基因组信息分析技术》,后将上述两门课程整合更名为《生物数据分析技能》,此前共计举办了20期。自本期会议起,会议升级为《生物数据分析技能2.0》,对课程内容与培训日程进行了大幅度调整,递进式专注讲解高通量数据解析:表达数据挖掘→共表达(聚类、富集、相互作用)分析→构建调控网络,以顺应学科发展和满足学员实际需要。授课继续沿用伦老师独创的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教学模式,着力于以真实问题为引线,将理论授课与上机实践有机地融为一体,逐步介绍涉及的各项技能,指导学员将其融会贯通并应用到课题研究中。TPS教学模式多年来在本科、研究生教学及20余期各类培训会议中取得了极佳的教学效果,受到广大学员的一致好评和推崇。

时间地点:
2019年7月19日-21日(7月18日报到)
南京锦江都城酒店(南京市雨花台区安德门大街50号)
主办单位
北京华斯泰生物医学科技有限公司
培训日程(所有课程均含上机实践)
日期
时间
授课题目 授课内容
7月18日
16:00-21:00
报到(外地学员)
7月19日
08:00-08:30
报到(本地学员)
08:30-09:00
预装软件、调试网络
09:00-12:00

表达谱差异数据挖掘

  • 差异表达基因集(DEGs)分析策略。
  • GEO数据库检索及数据集在线分析。
  • 利用GEO2R在线工具筛选获得差异表达基因集,并获得TCGA数据库交集结果。
16:00-17:30
表达谱数据聚类分析
  • 利用ArrayTools软件(设置各项参数)处理GEO数据库下载的表达谱数据。
  • 表达谱数据聚类分析。
  • 聚类图形优化工具。
7月20日
09:00-12:00
基因集功能富集分析
  • 利用DAVID、Metascape在线工具进行基因集功能富集分析(GO MF、GO BP、GO CC;KEGG Pathway)。
  • 绘制或下载基因集功能富集图。
  • 基因集韦恩图分析。
  • 基因集ID多元转换。
14:00-17:30
基因集相互作用分析
  • 利用String在线工具(设置各项参数)获得基因集相互作用结果。
  • mRNA-miRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-circRNA、mRNA-circRNA相互作用分析。
7月21日
09:00-12:00
交互作用数据可视化
  • 利用Cytoscape软件进行基因注释、分子间相互作用、基因集差异表达的可视化分析。
  • 批量修改交互网络的节点、边、背景属性。
  • 利用Cytoscape App进行基因集交互网络的GO富集分析、文本挖掘、关键/瓶颈基因及核心基因筛选。
  • 高分辨率可视化结果的保存与输出。
13:30-16:30
共表达调控网络构建
  • 构建基因集差异共表达Pathway/circRNA-mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA调控网络。
  • 靶点基因序列分析策略
具体事宜:
1. 培训期间提供午餐,晚餐自理。住宿统一安排在南京锦江都城酒店(南京南站店),主办单位可为学员代订房间,标准间单住380元/人、合住190元/人(含早餐),费用自理;学员也可自行上网预订。住宿费发票在退房时由酒店开具。对于需要合住的学员,会务组将按报到先后顺序安排,最后出现单人无法安排的情况,需要自补房间差价。
2. 上机实践需自带笔记本电脑(非上网本),会场将布置充足的电源插座。请确保电脑配置无线网卡(无线wifi覆盖会场)。为提高上网效率,推荐自行携带4G无线上网卡或具有热点共享功能的手机。操作系统为Win7/8/10 64位专业版(非任何商业版及Mac系统),办公软件为Office 2010以上专业版(非任何商业版及WPS Office),否则无法保证全部软件顺利安装和使用。
3. 授课幻灯、软件(附安装指南)及上机实践文档已上传至百度网盘,在报到通知中会告知链接及密码。软件请事先下载并安装,如安装有问题,请咨询客服或开课当天到会场咨询。
4. 严格按照培训日程授课(共计24标准学时),第三天16:30结课,方便外地学员返程。

会议费用:
2019年6月24日前报名并缴费3200元/人,6月24日后3400元/人(5人及以上团体报名并实际报到另优惠300元/人),(费用含午餐费和资料费);住宿统一安排,费用自理。
本次会议费委托合肥华斯泰生物医学科技有限公司收取并统一提供会务发票。
1.网上汇款或银行转账

户 名:合肥华斯泰生物医学科技有限公司
开户行:中国银行合肥临泉路支行
帐 号:181246448304
2.支付宝账号
名字:合肥华斯泰生物医学科技有限公司
账号:kf@Huasitai.com
3.现场刷卡或现金
您也可以现场刷卡和支付现金。可以刷公务卡
注:汇款时请务必注明“生物数据”和学员姓名,汇款后将回单电子邮件发给我们,以便我们确认。

联系方式:
联系人:章老师
手机号:13121195178(微信同号)
E-mail:Huasitai@263.net
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