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生物数据分析技能2.0(线上)实训会(总第24期)

点击次数:1042 发布日期:2020/07/27 来源:华斯泰

生物医学已进入大数据时代,借助生物医学多组学、多层次的海量数据,可以从前所未有的广度和深度来研究生物体运行机制。由于生物医学数据多呈分散复杂特征,以海量数据挖掘与分析为主体内容的生物信息学技能就成为科研必要手段,如疾病的病因学、临床诊断标志物、治疗或作用靶点识别,关键大分子的发现与功能预测,以及遗传调控机制等方面。本课程曾先后用名《基因序列分析技术》和《功能基因组信息分析技术》,后将上述两门课程整合更名为《生物数据分析技能》。自第21期会议起,会议升级为《生物数据分析技能2.0》,对课程内容与培训日程进行了大幅度调整,递进式专注讲解高通量数据解析:表达数据挖掘→共表达(聚类、富集、相互作用)分析→构建调控网络,以顺应学科发展和满足学员实际需要。授课继续沿用主讲教师独创的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教学模式,着力于以真实问题为引线,将理论授课与上机实践有机地融为一体,逐步介绍涉及的各项技能,指导学员在“零基础、零语言”前提下将其融会贯通并应用到课题研究中。TPS教学模式多年来在本科、研究生教学及20余期各类培训会议中取得了极佳的教学效果,受到广大学员的一致好评和推崇。

时间地点:
2020年9月25日-27日(两天一夜授课),使用腾讯会议客户端线上授课(非录播)。
主办单位
北京华斯泰生物医学科技有限公司,合肥华斯泰生物医学科技有限公司
培训日程
日期
时间
授课题目 授课内容
9月25日
19:00-19:30
报到、腾讯会议调试
19:30-20:30
软件安装
9月26日
08:30-10:00
表达谱差异数据挖掘
  • 差异表达基因集(DEGs)分析策略。
  • GEO数据库检索及数据集在线分析。
  • 利用GEO2R在线工具筛选获得差异表达基因集,并获得TCGA数据库交集结果。
10:00-11:30
表达谱数据聚类分析
  • 利用ArrayTools软件(设置各项参数)处理GEO数据库下载的表达谱数据。
  • 表达谱数据聚类分析。
  • 聚类图形优化工具。
14:30-17:30
基因集功能富集分析
  • 利用DAVID、Metascape在线工具进行基因集功能富集分析(GO MF、GO BP、GO CC;KEGG Pathway)。
  • 绘制或下载基因集功能富集图。
  • 基因集韦恩图分析。
  • 基因集ID多元转换。
19:00-22:00 基因集相互作用分析
  • 利用String在线工具(设置各项参数)获得基因集相互作用结果。
  • mRNA-miRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-circRNA、mRNA-circRNA相互作用分析。
9月27日
08:30-11:30
交互作用数据可视化
  • 利用Cytoscape软件进行基因注释、分子间相互作用、基因集差异表达的可视化分析。
  • 批量修改交互网络的节点、边、背景属性。
  • 利用Cytoscape App进行基因集交互网络的GO富集分析、文本挖掘、关键/瓶颈基因及核心基因筛选。
  • 高分辨率可视化结果的保存与输出。
14:30-17:30
共表达数据层级解析
  • 构建基因集差异共表达Pathway-mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA调控网络。
  • 靶点基因序列分析策略。
具体事宜:
1. 严格按照培训日程授课(21个标准学时)。需自备电脑(笔记本电脑非上网本),操作系统为Win7/8/10(非Mac系统),办公软件为Office 2007及以上(非WPS Office)。
2. 授课幻灯、软件(附安装指南)及上机实践文档已上传至百度网盘,在报到通知中会告知链接及密码。软件请事先下载并安装,如安装有问题,请咨询客服或报到当天线上咨询。
3. 为保证线上教学效果及良好课堂秩序,请务必留意以下说明:①确保网络畅通并始终处于静音状态,可以开启视频;②为保证音效,建议全程佩戴耳机收听;③有问题可以在本课程微信群中提出,会议主办方负责答复会务,主讲教师团队负责答复课程;④课程结束后,提供授课录屏链接,学员仍可通过微信群与主讲教师团队继续交流。

会议费用:
2800元/人,同一单位3人以上参会优惠至2500元/人。课程结束后快递发放纸质邀请函(盖章)和发票。学员本人今后可免费参加线下会议一次。
1.网上汇款或银行转账

户 名:合肥华斯泰生物医学科技有限公司
开户行:中国银行合肥临泉路支行
帐 号:181246448304
2.支付宝账号
名字:合肥华斯泰生物医学科技有限公司
账号:kf@Huasitai.com
注:汇款时请务必注明“生物数据”和学员姓名,汇款后将回单电子邮件发给我们,以便我们确认。

联系方式:
联系人:章老师
手机号:13121195178(微信同号)
E-mail:Huasitai@263.net
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