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日期
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时间
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授课题目
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授课内容
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5月28日
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8:30-12:00
理论
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DNA甲基化调控机制、科研应用及研究思路 |
1.明确DNA甲基化的作用机制及调控机理。 2.了解DNA甲基化在疾病等各研究领域中的应用。 3.了解DNA甲基化与转录组等多组学整合分析思路。 4.通过高分文章对DNA甲基化研究思路进行解读。 5.掌握DNA甲基化研究的多种技术方法。 6.了解常用DNA甲基化及疾病挖掘数据库。 |
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12:00-13:30
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午间休息
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13:30-17:00
实操 |
DNA甲基化芯片及测序数据分析 |
1.DNA甲基化芯片及测序分析常用软件介绍。 2.DNA甲基化芯片及测序数据分析策略。 3.DNA甲基化芯片及测序分析图表解读。 4.差异甲基化鉴定、注释及富集分析。 5.DNA甲基化芯片数据分析（ChAMP等软件）。 6.DNA甲基化测序数据分析（bismark，methylKit等软件）。 |
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5月29日
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8:30-12:00
理论
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RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析 |
1.了解RNA甲基化的概念和修饰类型。 2.明确RNA甲基化对RNA加工代谢、生物学功能及疾病中的调控机制。 3.通过高分文献思路示例及总结对RNA甲基化调控肿瘤等功能研究思路进行解析。 4.了解RNA甲基化常用的各种测序技术。 5.m6A甲基化的研究现状、思路和研究方法。 6.m6A测序技术流程介绍及测序报告解读。 7.m6A常见分析内容及相关软件介绍：m6A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析(R包exomePeak)、motif分析（Homer、MEME）及peak分布(RMBase)等。 8.m6A修饰基因的功能富集分析(DAVID，Metascape、GSEA等）。 9.预测m6A甲基化位点在线工具介绍。 10.m6A常用数据库介绍及使用（MeT-DB，m6AVar，RMBase）。 |
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12:00-13:30
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午间休息
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13:30-17:00
理论+实操
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m6A甲基化多组学整合分析，课题设计与基金申请 |
1. m6A甲基化测序的项目延伸及思路拓展。 2. m6A甲基化与多组学数据（RNA-seq，Ribo-seq等）整合分析。 3. 通过TGGA、ICGC等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路。 4. RNA甲基化研究策略与课题设计。 5. RNA甲基化研究经验交流。 6. RNA甲基化相关国自然课题的介绍。 7. DNA及RNA甲基化基金申请思路、准备内容及方案设计注意事项等。 8. 讨论及个性化问题答疑 |
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