近年来,微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用,成为了上述领域必不可少的研究技术。在此,北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。 专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值,为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加!
时间地点:
时间:2016年5月25日-27日地点:北京海淀区丰贤中路7号
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
主办单位:
北京市计算中心、华斯泰生物医学科技有限公司
北京市计算中心、华斯泰生物医学科技有限公司
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室、中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会、北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心、中国生物工程杂志
云计算关键技术与应用北京市重点实验室、中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会、北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心、中国生物工程杂志
课程内容:(上课时间:上午:9:30-12:00 下午:1:30-5:00)
| 日期 | 授课题目 | 授课内容 |
| 第一天 上午 | 微生物组学研究的发展和挑战 |
1、微生物组研究的发展历史 2、测序平台介绍 3、基于测序的研究方法 3.1 宏基因组(target sequencing 和全基因组) 3.2 单个微生物de novo测序 4、应用案例分析 |
| 第一天 下午 | target sequencing数据分析 |
1、linux常用命令使用和上机操作 2、数据分析过程中的编程简介(perl、R、python等) 3、target sequencing数据分析加上机 3.1质控 3.2去嵌合体 3.3 OTU聚类 3.4 注释 3.5统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。 |
| 第二天 全天 | Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析 |
1、质控 2、拼接组装:SOAPdenovo;MetaVelvet; Meta-IDBA等 3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等 4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等 5、功能注释:RAMMCAP;Blast等 6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)表达分析 |
| 第三天 全天 | 微生物de novo测序分析 |
1、 质控 2、 单细胞测序去污染、去嵌合体等 3、拼接组装:SPAdes等 4、基因预测 5、功能注释 6、代谢途径分析 7、进化分析:(1)SNP;(2)插入缺失(3)水平基因转移; 8、转录组分析:(1)基因差异表达分析;(2)代谢通路分析 |
【注】:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
收费标准::
注册费:工作人员4000元/人、学生3500元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
报名优惠政策:
1、4.15日前预报名的学员每人可优惠300元2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、同时报2个以上培训班的可额外优惠200元
5、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
联系方式:
韩海平 13121228066,010-57699238邮箱:haipinghan@163.com
010-63625100



