点击次数：2570 发布日期：2015/12/03 来源：华斯泰
组学和大数据是精准医学发展的基础，而二者的结合依赖于生物信息学的持续发展。生物信息学已经在生物领域获得广泛应用。医学的发展紧跟科研潮流，生物信息学已经在精准医学中成为焦点，成为精准医学前进的助跑器。北京市计算中心生物计算事业部联合国内精准医学研究一线科学技术人员希望能成为您的科研助力，特推出“生物信息学与精准医学”研习班。授课团队由具有多年遗传学、人类医学及计算科学研究经验的老师领衔，曾成功申请、主持或参与国内外多项重大课题，具有丰富的论文写作、发表经验，授课成员曾参与ENCODE计划，具有多年的NGS数据分析和TCGA使用经验。欢迎您参加！
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日期
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授课题目
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授课内容
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第一天
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精准基因组医学研究基础
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1、基因组信息学概论 2、精准基因组医学的机遇和挑战 |
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转录组数据分析I
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1、二代测序数据介绍 2、测序平台发展 3、测序数据格式详解 4、质量控制介绍 5、数据比对分析 6、转录组测序原理介绍 7、转录组研究重要性 8、转录调控、疾病分型、分析标记物介绍 9、转录组研究方法比较 10、数据分析流程详解 11、转录组数据分析上机实践 12、Linux操作 13、比对软件介绍 14、融合基因检测 15、差异表达分析 |
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第二天
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转录组数据分析II
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1、从转录组数据发现SNPs 2、RNA-seq鉴定SNP的优缺点 3、RNA-seq分析SNP流程详解及上机操作 4、从转录组数据预测lncRNAs 5、lncRNA调控机制 6、RNA-seq分析lncRNA流程及上机操作 |
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ENCODE计划及应用
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1、ENCODE计划介绍 2、ENCODE研究内容 3、ENCODE数据类型 4、ENCODE数据获取 5、ENCODE在线工具 6、利用ENCODE和GWAS数据进行疾病全基因组关联分析 7、GWAS相关疾病获取 8、ENCODE数据获取 9、ENCODE和GWAS数据共注释 |
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第三天
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ENCODE数据应用案例分析
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1、ENCODE数据应用案例分析 2、UCSC genome browser使用 3、基因相关信息的获取 4、疾病相关SNP注释 |
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TCGA数据及应用
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1、TCGA数据介绍 2、TCGA项目背景 3、TCGA项目包含的肿瘤类型 4、TCGA项目包含的数据类型 5、TCGA保护数据的申请 6、TCGA数据应用案例分析 7、TCGA文件查询 8、TCGA表达量结果文件下载 9、TCGA临床数据下载 10、表达数据与临床数据的整合分析 |
