点击次数：2254 发布日期：2016/03/28 来源：华斯泰
近年来，微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用，成为了上述领域必不可少的研究技术。在此，北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。 专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值，为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加！
| 日期 | 授课题目 | 授课内容 |
| 第一天 上午 | 微生物组学研究的发展和挑战 |
1、微生物组研究的发展历史 2、测序平台介绍 3、基于测序的研究方法 3.1 宏基因组（target sequencing 和全基因组） 3.2 单个微生物de novo测序 4、应用案例分析 |
| 第一天 下午 | target sequencing数据分析 |
1、linux常用命令使用和上机操作 2、数据分析过程中的编程简介（perl、R、python等） 3、target sequencing数据分析加上机 3.1质控 3.2去嵌合体 3.3 OTU聚类 3.4 注释 3.5统计分析：（1）α多样性分析；（2）β多样性分析；（3）群落结构及丰度分析；（4）进化分析；（5）差异分析(Lefse)；（6）功能分析(picrust)。 |
| 第二天 全天 | Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析 |
1、质控 2、拼接组装：SOAPdenovo；MetaVelvet; Meta-IDBA等 3、聚类Binning：TETRA; MetaCluster; Phymm等 4、基因注释：FragGeneScan；MetaGeneMark；MetaGeneAnnotator等 5、功能注释：RAMMCAP；Blast等 6、统计分析：（1）物种分析；（2）功能分析；（3）差异分析；（4）表达分析 |
| 第三天 全天 | 微生物de novo测序分析 |
1、 质控 2、 单细胞测序去污染、去嵌合体等 3、拼接组装：SPAdes等 4、基因预测 5、功能注释 6、代谢途径分析 7、进化分析：（1）SNP；（2）插入缺失（3）水平基因转移； 8、转录组分析：（1）基因差异表达分析；（2）代谢通路分析 |
