点击次数：8717 发布日期：2017/10/20 来源：华斯泰
随着高通量组学技术的蓬勃发展，生物医学正加速进入大数据时代。借助生物医学多组学、多层次的海量数据，可以从前所未有的广度和深度来研究生物体运行机制，但海量复杂数据带来的挑战同样巨大。由于生物医学数据多呈分散复杂特征，因此常需要深入分析已有数据。在此基础上，以海量数据发掘与解析为主体内容的生物信息学技能就成为科研必要手段，如疾病的病因学、临床诊断标志物、作用靶点识别，关键大分子的发现与功能预测，以及遗传调控机制等方面。会议特邀伦永志教授担任主讲教师。本课程曾分别用名《基因序列分析技术》和《功能基因组信息分析技术》，后将上述两门课程整合更名为《生物数据分析技能》。自本期会议起，伦老师对课程内容进行了较大幅度更新，以顺应学科发展趋势和学员需要。授课继续沿用伦老师独创的TPS（Teaching-Practicing-Showing）教学模式，着力于以实际问题为引线，将理论授课与上机实践有机地融为一体，逐步介绍涉及的各项技能，并指导学员将其融会贯通以真正掌握相关的基本方法与常用工具。TPS教学模式多年来在本科、研究生教学及二十余期培训会议中取得了极佳的教学效果，受到广大学员的一致好评和推崇。
| 日期 |
时间
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授课题目 | 授课内容 |
| 1月11日 |
16:00-21:00
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报到（外地学员） | |
| 1月12日 |
08:00-08:30
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报到（本地学员） | |
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08:30-09:00
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预装软件、调试网络 | ||
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09:00-12:00
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核酸信息注释 |
NCBI数据库常用资源：Nucleotide、Gene、Unigene子数据库的功能及信息注释；常见序列格式的转换。 EBI数据库常用资源：Ensembl、HGNC、Expression Atlas子数据库的功能及信息注释。 基因结构注释在线工具：内含子剪切位点、可变剪接、启动子序列、转录因子结合位点。 |
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14:00-18:00
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蛋白质信息注释 |
蛋白质序列数据库：UniProt数据库、PIR数据库的功能及信息注释。 蛋白质相互作用数据库：String数据库、IntAct数据库的信息注释。 蛋白质结构数据库：PDB数据库的信息注释 |
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| 1月13日 |
09:00-12:00
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非编码RNA信息注释及靶基因预测 |
miRBase/TargetScan数据库：miRNA信息注释及靶基因预测 Noncode/LncRNAdb数据库：LncRNA信息注释及靶基因预测 |
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14:00-18:00
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基因集功能富集分析 |
Gene Ontology、KEGG pathway数据库的信息注释 利用DAVID在线工具富集分析基因集功能 利用Excel软件/Venn在线工具绘制基因集功能富集图及维恩图（Venn分析） |
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| 1月14日 |
09:00-12:00
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基因表达数据处理与分析 |
利用ArrayTools软件处理从NCBI GEO子数据库下载的表达数据 利用Cluster/Treeview软件进行聚类分析 利用FunNet在线工具进行共表达网络分析 |
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14:00-17:00
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交互作用网络数据可视化分析 | 利用Cytoscape软件进行关联基因注释、文献检索及其交互关系、分子间相互作用及基因表达图形化分析。 |
