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第十期生物数据分析技能实训会

点击次数:5496 发布日期:2018/11/16 来源:华斯泰

随着高通量组学技术的蓬勃发展,生物医学正加速进入大数据时代。借助生物医学多组学、多层次的海量数据,可以从前所未有的广度和深度来研究生物体运行机制,但海量复杂数据带来的挑战同样巨大。由于生物医学数据多呈分散复杂特征,因此常需要深入分析已有数据。在此基础上,以海量数据发掘与解析为主体内容的生物信息学技能就成为科研必要手段,如疾病的病因学、临床诊断标志物、作用靶点识别,关键大分子的发现与功能预测,以及遗传调控机制等方面。会议特邀伦永志教授担任主讲教师。本课程曾分别用名《基因序列分析技术》和《功能基因组信息分析技术》,后将上述两门课程整合更名为《生物数据分析技能》。授课继续沿用伦老师独创的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教学模式,着力于以实际问题为引线,将理论授课与上机实践有机地融为一体,逐步介绍涉及的各项技能,并指导学员将其融会贯通以真正掌握相关的基本方法与常用工具。TPS教学模式多年来在本科、研究生教学及二十余期培训会议中取得了极佳的教学效果,受到广大学员的一致好评和推崇

时间地点:
2019年1月19日-21日(1月18日报到)
厦门维洛拉大酒店☆☆☆☆(厦门市思明区梧村街道大厝山路68号)
主办单位
北京华斯泰生物医学科技有限公司
培训日程(所有课程均含上机实践)
日期
时间
授课题目 授课内容
1月18日
16:00-21:00
报到(外地学员)
1月19日
08:00-08:30
报到(本地学员)
08:30-09:00
预装软件
09:00-12:00
核酸信息注释
  • NCBI数据库:Gene(参考序列)、Unigene(标准参考序列)、Nucleotide(非参考序列)数据库。
  • EBI数据库:HGNC(标准全称/缩写识别、转换)、Expression Atlas(表达图谱)子数据库。
14:00-16:00
核酸信息注释
  • 基因结构数据库:内含子剪切位点、可变剪接、启动子序列及分析策略、转录因子及其结合位点。
16:00-18:00
蛋白质信息注释
  • 蛋白质序列数据库:UniProt数据库。
  • 蛋白质相互作用数据库:String数据库。
  • 蛋白质三级结构数据库:PDB数据库。
  • 功能注释数据库:GO、KEGG数据库。
1月20日
09:00-12:00
非编码RNA信息注释及靶点分析
  • 非编码RNA注释、靶点预测、验证靶点、功能及疾病关联等数据库。
    1.miRNA:miRBase、TargetScan、miRTarBase、miRPath、miRDB等数据库。
    2.LncRNA:NONCODE、LNCipedia、lncRNAdb、LncBase等数据库。
    3.CircRNA:circBase、starBase、CircInteractome等数据库。
14:00-18:00
表达数据挖掘与聚类分析
  • 利用GEO2R在线工具进行GEO数据挖掘
  • 先利用ArrayTools软件处理从GEO数据库下载的表达数据,再利用Cluster/Treeview软件进行聚类分析。
  • 利用UALCAN在线工具进行TCGA数据挖掘
1月21日
09:00-12:00
基因集共表达分析
  • 基因集共表达分析策略
  • 利用DAVID在线工具进行基因集功能富集分析(GO、KEGG Pathway),并利用Excel软件/Venn在线工具绘制富集图/维恩图
  • 利用bioDBnet在线工具转换基因集ID
  • 基因集相互作用图形化分析
14:00-17:00
交互作用数据可视化分析
  • 利用Cytoscape软件进行关联基因注释及其交互关系、分子间相互作用、基因集差异表达、基因集共表达的可视化分析。
具体事宜:
1. 培训期间提供午餐,晚餐自理。
2. 上机实践需自带笔记本电脑(非上网本),会场将布置充足的电源插座。请确保电脑配置无线网卡(无线wifi覆盖会场),办公软件为Office 2007以上专业版(非任何商业版,非WPS Office),操作系统为Win 7/ 8/ 10专业版(非任何商业版、非Mac系统),否则无法保证本课程软件顺利安装和使用。
3. 为提高上网效率,建议学员自行携带4G无线上网卡或具有热点共享功能的手机。
4. 授课幻灯PDF版、软件(附带安装指南)及上机实践文档已上传至百度网盘,在报到通知中会告知链接及密码。软件请事先下载并安装,如安装有问题,请咨询客服或开课当天提前到达会场咨询。
5. 严格按照培训日程授课,最后一天(1月21日)下午仍有重要课程,外地学员需合理安排返程时间。
6. 住宿统一安排在厦门维洛拉大酒店,主办单位可为学员代订房间,标准间单住320元/人、合住160元/人(含早餐),费用自理;学员也可自行上网预订。住宿费发票在退房时由酒店开具。对于需要合住的学员,会务组将按报到先后顺序安排,最后出现单人无法安排的情况,需要自补房间差价。

会议费用:
2018年12月24日前报名并缴费2800元/人,12月24日后报名3200元/人 (5人团体报名另优惠300元/人),授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票
联系方式:
联系人:章老师
手机号:13121195178
E-mail:Huasitai@263.net
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  • 13366403928